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本系所歷年來曾與國科會、中山科學院、中國石油公司煉製研究所、雲林
縣政府、嘉義縣政府、台灣省政府教育廳、交通部電信研究所、資訊工業
策進會和教育部電算中心等，公民營機構積極進行合作計畫，從79年度至
今接受委託執行的研究計畫案已逾百餘件。
- 計算機系統及網路
- 高速網路
- 即時系統
- 即時資料庫
- 商用作業系之即時支援
- 安全容錯系統設計
- 網際網路
- 全球資訊伺服器
- 數位圖書館
- 多媒體資料庫管理與查詢系統
- 巨量新聞資料庫
- 計算機硬體、VLSI
- VLSI設計及測試
- 電路製造與測試之錯誤率分析
- 收穫率預測與管理
- 超大型積體電路易測試設計
- 一般用途中央處理機之測試
- 低功率高速度微控制器設計
- 計算機結構
- 快取記憶體設計
- 處理機架構設計
- 巨量多媒體儲存系統架構
- 模擬系統發展
- 平行處理與計算理論
- 平行處理與分散式計算
- 平行計算資料結構設計
- 容錯式平行計算
- 高速網路架構下分散式計算
- 程式語言
- 演算法設計
- 特殊圖
- VLSI / CAD
- 最佳組合
- 字串比對
- 資料擷取
- 物件導向技術
- WWW之Java程式語言客戶端的控制
- 物件導向資料庫（OODB）理論之探討
- 智慧型電腦輔助指令
- 影像處理與多媒體
- 影像及視訊處理
- 影像處理
- 影像壓縮/編碼
- 多媒體通訊
- 錯誤偵測與校正
- 視訊通信
- 模糊系統與類神經網路
- 類神經網路系統
- 模糊理論與系統
- 智慧型網路
- 電腦輔助教學
- 電腦密碼學
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