本校於民國78年7月1日正式建校，資訊工程研究所也於同年成立，為本校最早成立的五個研究所之一。81學年度成立大學部，翌年即成立博士班，使本系所成為中南部公立大學中，惟一涵蓋大學部、碩士班及博士班的完整學程之資訊系所。

本系所對未來研究工作方向已有清晰藍圖，在系統、理論及應用等方面專長之教授的群策群力之下，新加入之研究者可迅速發揮其研究專長。由於師資平均年齡輕，未來十年將進入研究工作的高峰期，加上中正大學為一綜合性大學，資訊科學在各學門之應用發展與合作相當容易推動。

均衡增設系所
短期內將落實大學部增班案，以自行培育優秀學生，並配合本校一系多所既定政策，積極規劃增設研究所。

繼續延攬優秀師資
訂定鼓勵辦法，協助延攬資深教師。

充實圖儀設備
推動大型研究群計劃，不斷更新圖儀設備。

努力提高研究水平
增加碩博士班名額，以期充實各重點研究領域之工作人力及研究水平；並強化跨實驗室研究方向彙整，規劃整合性專題討論課程。

積極提升教學制度
繼續推動以碩班生擔任大學部助教、博班生擔任碩班助教之制度，並於所有授課教室設置視聽影像等教學設備。

健全行政管理制度
擴充系統及系所務助理編制，提升行政工作品質。

繼續推廣社會服務
推動及爭取建教合作機會。

加強與國際、工業界及跨領域之合作
舉辦大型國際學術會議
編列固定經費促進學術交流
建立校際研究合作
充實學術網路宣傳網
國際研究成果交流
提供工業界發展所需研究服務
進行跨領域大型研究計畫

本系目前畢業之大學部學生，大部份進入研究所繼續深造攻讀碩士學位，而畢業之碩士班學生，部分繼續深造研究攻讀博士學位，其餘均投身於工業界、教育界從事資訊相關工作，為提升國內科技而努力。根據行政院經建會人力規劃處的最新統計資料指出，至民國100年，資訊工程畢業生仍將供不應求，而資訊工程高級人才（碩士以上）嚴重不足，每年平均不足達3,300人，所以可預知畢業出路是十分寬廣。